轉(zhuǎn)基因食品是否會(huì)對(duì)人體健康造成“潛在的傷害”，直到今天還存在巨大爭(zhēng)議和懸念。從事生物安全的專家，對(duì)被破壞又重建的基因鏈剛剛提出質(zhì)疑，從事生物技術(shù)的科學(xué)家就會(huì)用另外一整套數(shù)據(jù)予以反駁。 英國(guó)的一位研究人員最先公布的實(shí)驗(yàn)結(jié)果說(shuō)：用含有轉(zhuǎn)基因的馬鈴薯飼養(yǎng)大鼠，引起了大鼠器官生長(zhǎng)異常、體重減輕、免疫系統(tǒng)遭到破壞。實(shí)驗(yàn)結(jié)果立即引起轟動(dòng)，英國(guó)公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因食品的安全性紛紛表示懷疑。但是不久，英國(guó)皇家學(xué)會(huì)在專門對(duì)此組織的評(píng)審中，卻對(duì)這項(xiàng)實(shí)驗(yàn)指出6條缺陷：不能確定轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因馬鈴薯的化學(xué)成份有差異；對(duì)食用轉(zhuǎn)基因土豆的大鼠，未補(bǔ)充蛋白質(zhì)以防止饑餓；供試動(dòng)物數(shù)量少，飼喂幾種不同的食物，且都不是大鼠的標(biāo)準(zhǔn)食物，缺乏統(tǒng)計(jì)學(xué)意義；試驗(yàn)設(shè)計(jì)差，未作雙盲測(cè)定；統(tǒng)計(jì)方法不當(dāng)；試驗(yàn)結(jié)果無(wú)一致性等。

2002年，英國(guó)《自然》和美國(guó)《科學(xué)》雜志又陸續(xù)報(bào)道：紐卡斯?fàn)柕难芯咳藛T發(fā)現(xiàn)，轉(zhuǎn)基因食品中的DNA片段可以進(jìn)入人體腸道中的細(xì)菌體內(nèi)，這似乎證明腸道的菌群會(huì)對(duì)抗生素產(chǎn)生抗性。英國(guó)食品標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)為此做了關(guān)于轉(zhuǎn)基因食品安全的第一個(gè)人體實(shí)驗(yàn)———哈里·吉爾伯特等學(xué)者給12名健康志愿者和7名手術(shù)切除部分結(jié)腸的志愿者，吃了含轉(zhuǎn)基因大豆的漢堡包和牛奶冰激凌食品。結(jié)果發(fā)現(xiàn)：健康者的糞便中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因大豆的轉(zhuǎn)基因。但是，在那些切除過(guò)結(jié)腸的受試者的糞便中，確實(shí)發(fā)現(xiàn)了3.7％的大豆轉(zhuǎn)基因，這一結(jié)果提示：有極小量的細(xì)菌攝入了大豆轉(zhuǎn)基因。但這一數(shù)據(jù)沒(méi)有受到研究人員的重視，他們肯定地說(shuō)，沒(méi)有任何證據(jù)證明這種轉(zhuǎn)基因的漂移對(duì)人有副作用。英國(guó)皇家協(xié)會(huì)的研究指出基因食品可能帶來(lái)過(guò)敏等不良癥狀，而且對(duì)兒童和嬰兒的危險(xiǎn)尤其大。國(guó)際上許多國(guó)家和環(huán)保團(tuán)體都呼吁對(duì)基因食品進(jìn)行標(biāo)簽，進(jìn)而停止轉(zhuǎn)基因生物的商業(yè)性釋放。

在中國(guó)，科學(xué)家們對(duì)轉(zhuǎn)基因的安全也涇渭分明地分為兩派，中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)校長(zhǎng)陳章良接受采訪時(shí)說(shuō)，“我是一個(gè)堅(jiān)決支持轉(zhuǎn)基因的人。轉(zhuǎn)基因食品美國(guó)已經(jīng)吃了6年，我們已經(jīng)吃了3年，沒(méi)有見過(guò)有一個(gè)人吃了有什么不好的結(jié)果。中國(guó)大豆的50％是進(jìn)口的轉(zhuǎn)基因大豆，它們主要來(lái)自于美國(guó)和阿根廷，這些大豆主要用來(lái)榨油。我們吃的豆油、豆腐、豆?jié){等等，其實(shí)都是轉(zhuǎn)基因的，我們一直在吃，但并沒(méi)有什么問(wèn)題。”。我國(guó)中科院《科學(xué)新聞》發(fā)表的一篇文章，將轉(zhuǎn)基因食物“可能”對(duì)人類健康的危害總結(jié)為三點(diǎn)：一，轉(zhuǎn)基因作物中的毒素可引起人類急、慢性中毒或產(chǎn)生致癌、致畸、致突變作用；二，作物中的免疫或致敏物質(zhì)可使人類機(jī)體產(chǎn)生變態(tài)或過(guò)敏反應(yīng)；三，轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品中的主要營(yíng)養(yǎng)成份、微量營(yíng)養(yǎng)成份及抗?fàn)I養(yǎng)因子的變化，會(huì)降低食品的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值，使其營(yíng)養(yǎng)結(jié)構(gòu)失衡。到目前階段，對(duì)轉(zhuǎn)基因安全性的一個(gè)比較客觀的評(píng)價(jià)是：這是一個(gè)無(wú)法證實(shí)也無(wú)法證偽的命題。