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原位雜交(以斑馬魚為例)

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-06

固定
收集斑馬魚的胚胎,在Holfretor水中培養(yǎng),到達(dá)所需要的發(fā)育時(shí)期時(shí),用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小時(shí)后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗,然后換成甲醇,在-20C 保存,待用(兩天和兩天以上的胚胎需要用雙氧水處理,去除色素;蛘呤褂帽斤畴逑∪芤号囵B(yǎng),可阻斷色素的形成)
一. 原位雜交第一天
1. 重新水化和固定
1) 吸取固定好的胚胎,加入50%甲醇的PBST溶液,放置5分鐘。
2) 置換成30%甲醇的PBST溶液,放置5分鐘
3) 置換成PBST溶液,放置5分鐘,重復(fù)一次
4) 置換成4%多聚甲醛的PBS溶液固定20分鐘
5) 用PBST洗兩次,每次放置五分鐘,室溫。

蛋白酶處理與后固定(本實(shí)驗(yàn)不做此步)
1) 用10ul/ml的蛋白酶K在室溫下處理胚胎。5體節(jié)以下的胚胎不處理,5體節(jié)到24小時(shí)的胚胎處理3分鐘,24小時(shí)以上的胚胎處理5分鐘或者更長。發(fā)育時(shí)間越短的胚胎越嫩,可以不用或者少用蛋白酶處理,發(fā)育時(shí)間長的胚胎就需要用蛋白酶來疏松組織,以便于雜交。
2) 用PBST溶液輕洗,在PBST中放置5分鐘。
3) 用4%多聚甲醛的PBS溶液固定20分鐘,室溫。
4) 用PBST洗兩次,每次放置五分鐘,室溫。

2. 預(yù)雜交
1)每個(gè)管中置換成大約300ulHYB-溶液,60℃水浴5分鐘,避免振蕩。
2)用等體積的HYB+取代HYB-。
3)60℃水浴,預(yù)雜交4小時(shí)以上。

3. 雜交
1)吸去預(yù)雜交的HYB+,加上100ul已加入探針的HYB+溶液(探針濃度約為1ng/ul)..
2)60℃ 溫浴過夜。
注:雜交與預(yù)雜交的溫度可以是55到60度不等,溫度越低,探針結(jié)合越好,溫度越高,背景越小。

二. 原位雜交第二天
1.
1)將探針回收,放于-20C保存(通常探針可重復(fù)使用十次左右)。
2)加入50%甲酰胺/2XSSCT溶液1毫升,60℃,放置30分鐘,重復(fù)一次。
3)置換2XSSCT1ml,60℃,放置15分鐘。
4)置換0.2XSSCT1ml,60℃,放置30分鐘,重復(fù)一次。

2.
1)用MABT洗兩次,每次五分鐘,放在搖床輕輕搖動(dòng)。
2)室溫下加1ml 1:2:7溶液,時(shí)間為一小時(shí)。
3)按1:3000的比例在1:2:7溶液中加入酶連地高辛抗體,4C 冰箱過夜。

三. 原位雜交第三天
1) 用1ml含10%熱滅活血清的MABT溶液置換抗體溶液,放置搖床上25分鐘,然后用1mlMABT置換,25分鐘,再用1mlMABT溶液置換,一小時(shí)以上,最后用1mlMABT溶液置換,25分鐘。
2) 用1ml 1mM左旋米睉的Staining buffer洗三次,每次放置五分鐘。
3)將胚胎轉(zhuǎn)入十六孔板中,吸去staining buffer,加上300ul BM Purple AP Substrate(底物,用之前加5mM左旋米唑),十六孔板外面包上錫箔紙以避光,避免搖動(dòng),室溫下顯色。
4)每隔一小時(shí)觀察胚胎是否開始顯色
5)將顯色完全的胚胎中的底物吸出,用PBST洗兩三次后加上4%多聚甲醛固定,拍照。
6)4C冰箱保存。

原位雜交中溶液的配制:
PBS:
NaCl 8g
KCl 0.2g
Na2HPO4 1.44g
KH2PO4 0.24g
DEPC H2O 1L
HCl 調(diào)PH值至7.4
抽濾,滅菌

4% 多聚甲醛:
多聚甲醛 40g
PBS 1L
加熱持續(xù)攪拌至溶液澄清。-20℃保存

PBST:
PBS溶液加上Tween-20使其終濃度為0.1%。

20XSSC:
Na3Citrate 2H2O 88.2g
NaCl 175.5g
DEPC H2O 至1L
抽濾,滅菌

SSCT:
SSC加上Tween-20使其終濃度為0.1%。

HYB-:
甲酰胺:20XSSC儲(chǔ)液:DEPC水=2:1:1配制
加入Tween-20使其終濃度為0.1%,-20c保存。

HYB :
HYB- 20ml
yeast RNA 10mg
heparin 1mg。
-20℃保存。

MAB:
maleic acid 11.6g
NaCl 8.8g
用固體NaOH(約7g)調(diào)至Ph=7.5
4℃保存

MABT
MAB加上Tween-20使其終濃度為0.1%.

10% blocking reagent:
blocking reagent 8g
MAB 72ml

1:2:7溶液:
滅活羊血清:10% BM blocking reagent:MABT=1:2:7
用時(shí)現(xiàn)配

Staining buffer:
Tris 12.1g
pH9.5
Mgcl 6H2O 10.2g,
Nacl 5.85g
Tween-20 1ml,
用之前加1M的左旋咪唑儲(chǔ)液,使之終濃度為1mM

 
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