世界上許多國家的食品安全保障體系一般由6個部分組成，即法律法規(guī)和標準體系、檢驗檢測體系、認證認可體系、執(zhí)法監(jiān)督體系、技術推廣體系和市場信息體系。通過第三方認證機構的認證活動來加強農產品、食品生產和經營企業(yè)安全體系的建設已經成為保障食品安全的重要手段，同時也降低了行政成本，分散行政風險。
認證是當前國際通行的農產品和食品質量安全管理手段，其最具有特色且起著重要作用的功能在于：一是有利于推進標準化的貫徹實施，便于規(guī)范農產品種養(yǎng)過程及食品加工、銷售等環(huán)節(jié)，促使農產品及食品的生產者、經營者及相關管理者樹立標準意識和質量意識。二是判定農產品、食品是否符合標準，是由處于公正地位的專業(yè)化的認證機構做出的。它以不同于農產品種植、養(yǎng)殖方和食品加工方(即第一方)與批發(fā)商、經銷商(即第二方)的第三方身份，對獲得認證的產品持續(xù)符合標準和技術規(guī)范的要求提供證明，并承擔保障認證結果公正和有效的責任。三是有利于解決當前國際農產品及食品貿易遇到的技術壁壘，通過農產品、食品認證的國際互認，便于我國農產品、食品順利走出國門。四是開展認證適應了政府職能轉變和機構改革形勢，有利于政府從直接實施產品質量安全檢驗檢測等行政審批性質(直接承擔著質量安全的責任)的工作中解脫出來，減少政府的責任和風險，因而對于深化行政管理體制改革，提高政府行政效能，從源頭上預防和治理腐敗，也具有重要意義。
目前，管理農產品、食品質量安全的方式方法有很多。既有政府的農產品及食品的市場準入制度，出口食品法定檢驗檢疫，企業(yè)和批發(fā)、經銷商的檢驗，還有由認證機構對農產品、食品進行的質量認證。國家正式推出的產品認證形式有：無公害農產品認證、綠色食品認證、有機食品認證和飼料產品認證。此外，國內還存在有各部門的多種產品認證形式：食用農產品安全認證、安全飲品認證、安全食品認證、健康食品認證等。國家已經推出的管理體系認證形式有：基于HACCP的食品質量安全管理體系認證、用于流通領域的綠色市場認證，可應用于農產品和食品領域的質量管理體系ISO9000認證和環(huán)境管理體系ISO14000認證等。正在研究和準備的認證形式有：良好農業(yè)規(guī)范(GAP)認證、ISO22000食品安全管理體系認證、食品零售商采購審核標準(GFSI)認證等。
申請者應根據(jù)農業(yè)生產條件及自身經濟承受能力，確定產品的消費層次和消費群體，產品實施現(xiàn)有的無公害農產品、綠色食品、有機食品認證制度，即滿足一般消費者對質量安全的基本要求，又適應不同消費層次比較高的要求；農產品生產基地實施良好農業(yè)規(guī)范(GAP)認證，因為GAP是一套針對初級農產品生產的操作標準，它關注種植、養(yǎng)殖、采收、清洗、包裝、貯藏和運輸過程中的有害物質和有害微生物危害控制；農產品、食品加工企業(yè)實施基于HACCP的食品質量安全管理體系認證；流通環(huán)節(jié)實施食品零售商采購審核標準(GFSI)認證。