親本數(shù)目不一，使用先后不同來配制雜交組合的方式。講求雜交方式之意義在于創(chuàng)造符合育種目標(biāo)的變異群體，加大選獲期望重組體(組合)的可能性。常用的有單交、三交、雙交、回交等方式。用兩個(gè)以上親本雜交通稱多交或復(fù)合雜交。
單交 A/B(/表示第一次雜交)，兩個(gè)親本進(jìn)行一次雜交，也稱成對雜交，是最簡單的雜交方式。單交有正交和反交之分。A/B為正交，則B/A為反交，反之也然。
三交 A/B//C或A//B/C(//表示第二次雜交)，一般在兩個(gè)親本不具備育種目標(biāo)所要求的全部性狀時(shí)需要啟用第三個(gè)親本，配置成三交組合。應(yīng)把綜合性狀較好的產(chǎn)量親本作為第二次雜交親本使用。
雙交 典型的雙交包括四個(gè)親本，A/B//C/D。雙交可以把更多的目標(biāo)性狀集中到一個(gè)群體中去，在育種目標(biāo)要求性狀較多時(shí)應(yīng)用。三親本雙交A/C//B/C與三交相似之處是三個(gè)親本A、B、C所占的遺傳劑量在理論上與典型的三交相同；三親本雙交F1群體內(nèi)個(gè)體間的差異比典型三交F1群體為大，更有利于選擇。
循序雜交 是一種不斷引用新親本的復(fù)合雜交，如A/B//C/B/3/D/4/E……(//中的數(shù)字表示第若干次雜交)，目的在于不斷修正已配制組合的缺點(diǎn)。要求每一親本的綜合性狀水平都較高，否則不易收到預(yù)期效果。
復(fù)合雜交 從F1代起性狀即發(fā)生分離，宜從F1代開始選擇，而不像單交那樣從F2代開始；由于牽涉到的性狀較多，變異范圍廣，其F1代群體必須保持一定規(guī)模，才有可能選出合乎要求的后代，因此要多作些雜交稻。應(yīng)根據(jù)性狀分離的顯隱性關(guān)系合理掌握選擇強(qiáng)度，一般可適當(dāng)多選些單株，中選的單株后代群體也需適當(dāng)擴(kuò)大。與單交相比，復(fù)交后代群體變異范圍大、種類多，有可能選到具有符合更多目標(biāo)性狀的重組體。在進(jìn)行第三次以上的雜交時(shí)，父母本之一或雙方都在分離，要求較準(zhǔn)確地選擇優(yōu)良單株進(jìn)行雜交。