小麥根腐病易防難治，應以預防為主，發(fā)現(xiàn)病株后及時用藥治療。可以在發(fā)病初期，選用烯唑醇、丙環(huán)唑、三唑酮、多菌靈、甲基硫菌靈等藥噴霧防治。噴藥應噴勻、噴透，使藥液充分浸透根、莖。播前選用三唑類殺菌劑拌種，是預防該病的最有效措施。

紋枯病和全蝕病也會使小麥莖基部腐爛，葉片發(fā)黃。將病苗拔起，仔細檢查麥苗發(fā)病部位及根系，可以區(qū)分這幾種病害。小麥紋枯病主要發(fā)生在葉鞘及莖稈上，初期在近地面的葉鞘上產(chǎn)生褐色梭形病斑，中央淡褐色或灰白色，以后逐漸擴大并擴展至莖稈上，顏色變深，重病株莖基部１～２節(jié)變黑甚至腐爛，常出現(xiàn)早期死亡。紋枯病病株莖和葉鞘基部通常受到破壞，手拔病苗常將麥苗基部拔斷而不能將根拔起。小麥發(fā)生全蝕病后，根部和莖基部１～２節(jié)變黑，植井岡霉素及株矮小，葉片自下而上逐漸發(fā)黃，輸導組織逐漸壞死，生長受阻、發(fā)育不良，抽穗后田間出現(xiàn)成簇白穗或連片白穗。“黑腳”和白穗是該病的典型癥狀。全蝕病病株根系受到破壞，通常輕輕一拔就起，除粗根還殘留一部分外，其余根都會被拔斷。

對小麥紋枯病，可以在發(fā)病初期噴施烯唑醇、丙環(huán)唑、戊唑醇、己唑醇等三唑類藥防治。小麥發(fā)生全蝕病后也可以用三唑類藥噴霧防治，但防治效果不理想。全蝕病主要應在播前用苯醚甲環(huán)唑、戊唑醇、腈菌·戊唑醇、硅噻菌胺等藥拌種預防。