綠色食品開發(fā)管理體系由四個(gè)基本部分組成：嚴(yán)密的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)體系、全程質(zhì)量控制措施、網(wǎng)絡(luò)化的組織系統(tǒng)、規(guī)范化的管理方式。
　　

　　(一)嚴(yán)密的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)體系。綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、生產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)、產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)、產(chǎn)品包裝標(biāo)準(zhǔn)和儲(chǔ)藏、運(yùn)輸標(biāo)準(zhǔn)構(gòu)成了綠色食品一個(gè)完整的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)體系。
　　

　　綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)要求綠色食品初級(jí)產(chǎn)品和加工產(chǎn)品主要原料的產(chǎn)地，其生長區(qū)域內(nèi)沒有工業(yè)企業(yè)的直接污染，水域上游和上風(fēng)口沒有污染源對(duì)該地區(qū)域直接構(gòu)成污染威脅，從而使產(chǎn)地區(qū)域內(nèi)大氣、土壤、水體等生態(tài)因子符合綠色食品產(chǎn)地生態(tài)環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)，并有一套保證措施，確保該區(qū)域在今后的生產(chǎn)過程中環(huán)境質(zhì)量不下降。
　　

　　綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)指綠色食品種植、養(yǎng)殖和食品加工各個(gè)環(huán)節(jié)必須遵循的技術(shù)規(guī)范。該標(biāo)準(zhǔn)的核心內(nèi)容是：在總結(jié)各地作物種植、畜禽飼養(yǎng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖和食品加工等生產(chǎn)技術(shù)和經(jīng)驗(yàn)的基礎(chǔ)上，按照綠色食品生產(chǎn)資料使用準(zhǔn)則要求，指導(dǎo)綠色食品生產(chǎn)者進(jìn)行生產(chǎn)和加工活動(dòng)。


　　綠色食品最終產(chǎn)品必須由定點(diǎn)的食品監(jiān)測機(jī)構(gòu)依據(jù)綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)檢測合格。綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)是以國家標(biāo)準(zhǔn)為基礎(chǔ)，參照國際標(biāo)準(zhǔn)和國外先進(jìn)技術(shù)制定的，其突出特點(diǎn)是產(chǎn)品的衛(wèi)生指標(biāo)高于國家現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)。


　　綠色食品產(chǎn)品包裝標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了產(chǎn)品包裝必須遵循的原則、包裝材料的選擇、包裝標(biāo)識(shí)內(nèi)容等要求，目的是防止產(chǎn)品遭受污染，資源過度浪費(fèi)，并促進(jìn)產(chǎn)品銷售，保護(hù)廣大消費(fèi)者的利益，同時(shí)有利于樹立綠色食品產(chǎn)品整體形象。


　　(二)全程質(zhì)量控制措施。綠色食品生產(chǎn)實(shí)施"從土地到餐桌"全程質(zhì)量控制，以保證產(chǎn)品的整體質(zhì)量。在綠色食品開發(fā)過程中，生產(chǎn)前由定點(diǎn)環(huán)境檢測機(jī)構(gòu)對(duì)綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量進(jìn)行監(jiān)測和評(píng)價(jià)，以保證生產(chǎn)地域沒有遭受污染；生產(chǎn)過程中，由委托管理機(jī)構(gòu)派檢查員檢查生產(chǎn)者是否按照綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行生產(chǎn)，檢查生產(chǎn)企業(yè)的生產(chǎn)資料購買、使用情況，以證明生產(chǎn)行為對(duì)產(chǎn)品質(zhì)量和產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量是有益的；產(chǎn)后由定點(diǎn)產(chǎn)品監(jiān)測機(jī)構(gòu)對(duì)最終產(chǎn)品進(jìn)行監(jiān)測，確保最終產(chǎn)品質(zhì)量。


　　(三)科學(xué)、規(guī)范的管理手段。中國綠色食品實(shí)行統(tǒng)一、規(guī)范的標(biāo)志管理，即通過對(duì)合乎特定標(biāo)準(zhǔn)的產(chǎn)品發(fā)放特定的標(biāo)志，用以證明產(chǎn)品的特定身份以及與一般同類產(chǎn)品的區(qū)別。從形式上看，綠色食品標(biāo)志管理是一種質(zhì)量認(rèn)證行為，但綠色食品標(biāo)志是在國家工商行政管理局注冊(cè)的一個(gè)商標(biāo)，受《中華人民共和國商標(biāo)法》嚴(yán)格保護(hù)，在具體運(yùn)作上完全按商標(biāo)性質(zhì)處理。因此，綠色食品在認(rèn)定的過程中是質(zhì)量認(rèn)證行為，在認(rèn)定后是商標(biāo)管理行為，也就是說，綠色食品標(biāo)志管理實(shí)現(xiàn)了質(zhì)量認(rèn)證和商標(biāo)管理的結(jié)合。實(shí)現(xiàn)這個(gè)結(jié)合既使綠色食品的認(rèn)定具備產(chǎn)品質(zhì)量認(rèn)證的嚴(yán)格性和權(quán)威性，又具備商標(biāo)使用的法律地位。實(shí)施綠色食品標(biāo)志管理不僅可以有效地規(guī)范企業(yè)的生產(chǎn)和流通行為，而且有利于保護(hù)廣大消費(fèi)者的權(quán)益；不僅可以有效地促進(jìn)企業(yè)爭創(chuàng)名牌，開拓市場，而且有利于綠色食品產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。從另一個(gè)角度來看，綠色食品標(biāo)志的商標(biāo)注冊(cè)和規(guī)范使用，使綠色食品具有了可識(shí)別性。其經(jīng)濟(jì)學(xué)意義在于：一方面，可識(shí)別性使綠色食品再生產(chǎn)過程的內(nèi)在價(jià)值得以體現(xiàn)；另一方面，可識(shí)別性使綠色食品再生產(chǎn)過程的內(nèi)在特征外在化，從而為綠色食品逐步發(fā)展成為相對(duì)獨(dú)立的產(chǎn)業(yè)創(chuàng)造了條件。


　　(四)高效的組織網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。為了將分散的農(nóng)戶和企業(yè)組織發(fā)動(dòng)起采進(jìn)入綠色食品的管理和開發(fā)序列，中國綠色食品發(fā)展中心構(gòu)建了三個(gè)組織管理系統(tǒng)，并形成了高效的網(wǎng)絡(luò)：一是在全國各地委托了分支管理機(jī)構(gòu)，協(xié)助和配合中國綠色食品發(fā)展中心開展綠色食品宣傳、發(fā)動(dòng)、指導(dǎo)、管理、服務(wù)工作；二是委托全國各地有省級(jí)計(jì)量認(rèn)證資格的環(huán)境監(jiān)測機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)綠色食品產(chǎn)地環(huán)境監(jiān)測與評(píng)價(jià)；三是委托區(qū)域性的食品質(zhì)量監(jiān)測機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)綠色食品產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)測。綠色食品組織網(wǎng)絡(luò)建設(shè)采取委托授權(quán)的方式，并使管理系統(tǒng)與監(jiān)測系統(tǒng)分離，這樣不僅保證了綠色食品監(jiān)督工作的公正性，而且也增加了整個(gè)綠色食品開發(fā)管理體系的科學(xué)性。