脊椎動物細胞中有三種類型的核纖層蛋白(A,B,C), 核纖層蛋白A和C是由同一個轉錄單位編碼的, 只不過是通過可變剪接形成不同的mRNA。它們在肽鏈上的差別是:核纖層蛋白A的C末端比核纖層蛋白C的C末端多133個氨基酸殘基。核纖層蛋白B是由另一個轉錄單位編碼的, 通過轉錄后的修飾,在羧基端添加了疏水的異丙基, 添加的脂肪酸幫助核纖層蛋白B插入到核膜的內(nèi)脂層。三種類型的核纖層蛋白都以二聚體的形式存在, 有球形的頭和尾部結構域以及一個桿狀的α螺旋中心。這些核纖層蛋白二聚體以頭-頭、尾-尾相接的方式形成核纖層。