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基因組數(shù)據(jù)庫

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-09-19
    基因組數(shù)據(jù)庫(GDB)為人類基因組計劃(HGP)保存和處理基因組圖譜數(shù)據(jù)。GDB的目標(biāo)是構(gòu)建關(guān)于人類基因組的百科全書,除了構(gòu)建基因組圖譜之外,還開發(fā)了描述序列水平的基因組內(nèi)容的方法,包括序列變異和其它對功能和表型的描述。目前GDB中有:人類基因組區(qū)域(包括基因、克隆、amplimers PCR 標(biāo)記、斷點breakpoints、細(xì)胞遺傳標(biāo)記cytogenetic markers、易碎位點fragile sites、EST序列、綜合區(qū)域syndromic regions、contigs和重復(fù)序列);人類基因組圖譜(包括細(xì)胞遺傳圖譜、連接圖譜、放射性雜交圖譜、content contig圖譜和綜合圖譜等);人類基因組內(nèi)的變異(包括突變和多態(tài)性,加上等位基因頻率數(shù)據(jù))。GDB數(shù)據(jù)庫以對象模型來保存數(shù)據(jù),提供基于Web的數(shù)據(jù)對象檢索服務(wù),用戶可以搜索各種類型的對象,并以圖形方式觀看基因組圖譜。
 
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