小孢子 microspore 在孢子分大小兩形時其小形者稱為小孢子。在蕨類植物，小孢子囊中產(chǎn)生32個或64個小孢子，可萌發(fā)形成極度退化的由幾個細胞構(gòu)成的雄性原葉體。水生蕨類的槐葉萍（Salvinia natans）、滿江紅（Azol-la imbricata）的小孢子，在小孢子囊內(nèi)萌發(fā)時，可產(chǎn)生由四個營養(yǎng)細胞、兩個精子器構(gòu)成的雄性原葉體，由于生長的壓力，孢子壁破裂而一部分裸露出來。另外被子植物和裸子植物花藥內(nèi)的各花粉四分體也稱為小孢子，它們將來發(fā)育成與雄性原葉體相同的花粉粒，因此認為它是相當于蕨類植物的小孢子。
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