這一方法需要用蔗糖或甘油制備輕微的連續(xù)密度，然后將待分離的樣品加在離心管的最上層，形成一狹窄的帶，再通過(guò)較長(zhǎng)時(shí)間的離心。在離心過(guò)程中，大小、形狀、密度不同的顆粒就會(huì)分開，最后收集各區(qū)帶得到要分離的物質(zhì)。在此方法中，分離介質(zhì)對(duì)被分離的物質(zhì)必須是中性無(wú)害的，并且密度梯度較低，底部的密度比管頂部的密度大，建立密度梯度的目的是防止擴(kuò)散。重要的是，待分離顆粒的密度比離心管中任何部分介質(zhì)的密度都要大。常用的是蔗糖密度梯度離心(sucrose density gradient centrifugation)。