一、作物自毒作用。某些作物可通過地上部分淋溶、根系分泌和作物殘茬腐解等途徑釋放一些物質(zhì)，對同茬或下茬或同科作物生長發(fā)育產(chǎn)生抑制作用，這種現(xiàn)象叫自毒作用。

　　二、土壤有益微生物減少、有害微生物增加。由于連作，形成了特殊的土壤環(huán)境，使固氮菌、根瘤菌、光合菌、放線菌、硝化菌、氨化細(xì)菌、菌根真菌等有益微生物的生長繁殖受到抑制，而有害微生物大量滋生，土壤就會發(fā)生變化。

　　三、土壤性質(zhì)變壞，次生鹽漬化及土壤酸化嚴(yán)重。為了片面的追求高產(chǎn)，大量施入高含量的化學(xué)肥料和未經(jīng)腐熟的動(dòng)物糞便、人尿糞等，導(dǎo)致土壤中鹽分過量。

　　四、線蟲危害。線蟲是作物寄生蟲，主要破壞作物的根系，影響其正常生長，而且防治難度大。

　　農(nóng)作物連作危害的防治：

　　一、施肥：測土配方，平衡施肥，調(diào)節(jié)營養(yǎng)，以有機(jī)肥為主，有機(jī)肥和無機(jī)肥相結(jié)合。

　　二、管理：輪作間作，優(yōu)種嫁接。

　　三、栽培：土壤消毒，藥治菌補(bǔ)。